Baki  ist der Sensei von Gaara, Temari und Kankuro. Während der Chunin-Auswahlprüfung war er der Abgesandte von Sunagakure, bei der er seine Schüler im Auge behielt und mit Kabuto Yakushi die Invasion Konohas plante. Bei einer Unterhaltung wurden sie von Hayate Gekko belauscht. Allerdings blieb dessen Anwesenheit nicht verborgen und Baki bot Kabuto an, ihn als Zeichen seiner Loyalität umzubringen. Auch wenn es Hayate gelingt, Baki mit seinem Schwert zu treffen, wird er von dessen "Windschwert"  zur Strecke gebracht. Baki führte bei der Invasion die Sand- und Klangshinobis an. Im Stadion duellierte er sich mit Genma Shiranui, in einem Kampf, der vermutlich ohne klaren Sieger endete, da beide ohne nennenswerte Verletzungen später noch einmal zu sehen sind.

Letztendlich bereut Baki die Zusammenarbeit mit Orochimaru, als er erfährt, dass dieser heimlich den Kazekage getötet hatte.

Baki ist eines der Ratsmitglieder von Sunagakure. Hier gehört er zu den Wenigen, die dem neuen Kazekage Gaara auch wirklich Vertrauen entgegen bringen.

Als Kankuro von Sasori verletzt wurde, schien Baki sehr um die Gesundheit seines ehemaligen Schülers besorgt zu sein.